在接連發生過數場大規模戰爭後，過去曾以繁華為傲的諸國已滅亡，陷入了整片大地都是瓦礫殘骸的時代。 就在終於見到復興徵兆的時候，突然出現的神秘病毒「黃化病毒」卻在全土蔓延開來，失去自我的感染者開始襲擊眾人。為了保護自身遠離威脅，殘存的人們不得不接受侷限在城塞都市裡的生活。然而在城牆內，前領主亡故之後，新領主董卓卻無視民間疾苦地胡作非為。 有如受到命運的引導，劉備獨角獸鋼彈結識了關羽ν鋼彈和張飛神鋼彈，並且下定決心要拯救世界。在這三名年輕人的熱血情懷帶動下，世界即將產生巨大的變化。 全新的英雄豪傑們將開創出嶄新時代！
