「它们就在你的身边」—— 在新科技发展的近未来，社群网路上流传着被称为「全像幽灵」（Hologram Ghost）的真假不明的怪奇现象的传闻。国中一年级学生天之河宙，因为启动了父亲留下的被称为「人体连动育成手环 暴龙机 - V-」（Vital Bracelet Digivice-V-）的神秘设备，开始能看到大家看不见的未知生物 ——「数码兽」。从与父亲所托付的顽皮数码兽「伽马兽」相遇的那天开始，宙就被卷入了各种怪奇现象中。盗取人类时间的「缝口男」，或是在夜晚徘徊并掳走人类的「木乃伊男」…… 全像幽灵，就在大家身边伺机而动。由此开始，便是无人知晓的世界背后的故事。宙、伽马兽和伙伴们一起，踏入了生存着数码兽们的不可思议的世界中。
